骨骼发育不全是由于遗传因素或营养缺乏导致的骨结构异常。

遗传因素：家族中存在相关疾病史，可能导致基因突变，从而影响骨骼发育。

例如软骨发育不全是一种常染色体显性遗传病，可表现为身材矮小和四肢短粗。

营养缺乏：钙质及维生素D摄入不足会影响骨骼矿化过程，造成骨骼脆弱易折断。若长期处于缺钙状态，会导致骨骼密度降低，出现骨骼发育不良的情况。

此外，生长激素缺乏症也可能引起儿童身高低于同龄人，但通常与遗传无关。其原因可能是下丘脑或垂体功能障碍，导致生长激素分泌减少。

因此，在诊断骨骼发育不全时，应考虑各种可能的因素，并建议患者及时就医以确定具体原因并接受适当治疗。