做完肛瘘手术后疼痛几天，取决于手术创面是否存在感染，以及病人的恢复情况。肛瘘是指肛管直肠周围的肉芽肿性管道，大部分由直肠肛管周围脓肿引起，表现为自瘘外口出现分泌物，从而发生肛门周围的皮肤潮湿、瘙痒、肿痛，大部分患者可能会出现明显的疼痛。

1、感染：如果在做完肛瘘手术后未注意局部护理，可能会导致局部感染。当细菌感染皮肤组织后，会引起软组织水肿，从而出现明显的疼痛。如果及时进行抗感染治疗，如使用头孢曲松钠、阿奇霉素等药物，可能疼痛1-2天即可缓解;

2、恢复较慢：如果病人的身体素质比较差，并且肛瘘的位置比较深，手术创面较大，恢复时间可能会比较长。如果后续进行规律换药，可能会在2周左右疼痛才会逐渐缓解。部分病人可能会出现切口出现积脓，这时疼痛的时间会相应延长，甚至会持续1个月左右。如果及时进行处理，可以避免感染进一步扩散，缩短疼痛时间;

3、创面较大：如果病人存在糖尿病等基础疾病，肛瘘的切口创面相对较大，而且切口位置也比较深，后期恢复时间可能会比较长。如果积极治疗原发病，如控制血糖、改善血液循环等，可能会使疼痛缓解的时间相应延长，甚至持续2-3个月;

4、其他原因：如果在做完肛瘘手术后未注意饮食，如摄入辛辣、刺激性食物，或饮酒等，可能会刺激切口，而导致局部疼痛加重。

肛瘘手术后要注意切口的护理，在大便后可使用温水清洗肛门，保持局部清洁、卫生，可在一定程度上缓解疼痛的症状。另外，还建议病人在术后遵医嘱使用高锰酸钾溶液坐浴，可以促进肛门周围的血液循环，起到消肿止痛的作用。