如果蹲着小便有刺痛感，可能是尿道炎、膀胱炎、痔疮所导致，也有可能是其他疾病引起，如尿道结石。建议患者及时就医，查明病因，再进行对症治疗。

1、尿道炎：通常是卫生清洁不到位，使细菌侵入尿道，而引发感染，会使尿道黏膜受到损伤，从而出现蹲着小便有刺痛感的情况。此时建议多饮水、多排尿，情况严重的患者可在医生指导下，使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗;

2、膀胱炎：可能是患者长期憋尿，导致膀胱压力增大，继而使膀胱受到损伤，细菌上行感染从而引发炎症，导致出现蹲着小便有刺痛感的现象。此时建议患者及时就医，在医生指导下使用碳酸氢钠片、盐酸环丙沙星片、头孢呋辛酯片等药物进行治疗;

3、痔疮：如果患者存在痔疮，当痔疮发生脱出时，会导致小便后擦拭困难，使局部皮肤黏膜受到损伤，从而出现蹲着小便有刺痛感的情况。此时建议患者及时就医，使用合适的高锰酸钾溶液进行坐浴，还可使用痔疮栓等药物进行治疗;

4、其他疾病：如果患者存在慢性肾盂肾炎、肾结石等疾病，在蹲着的时候，结石在局部活动，会刺激黏膜，从而导致患者出现蹲着小便有刺痛感的情况。慢性肾盂肾炎患者可在医生指导下使用头孢氨苄胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗，肾结石患者可在医生指导下使用体外冲击波碎石治疗、经皮肾镜取石术等。