鼻窦囊肿手术通常不会有明显的后遗症。

该手术是通过内窥镜技术在医生监控下完成的微创手术，可以清晰地观察到囊肿的位置和大小，并精确切除，减少对正常组织的损伤，因此风险较小。此外，手术中会使用局部麻醉或全身麻醉，确保患者的舒适度和安全性。

对于复杂的囊肿或伴有感染的患者，在术后可能会出现慢性炎症反应，需要定期随访和药物治疗，以防止并发症的发生。

在接受鼻窦囊肿手术时，应严格遵循医嘱，注意休息，避免剧烈运动，保持鼻腔清洁，促进伤口愈合，减少术后不适。