功能性便秘多由肠道蠕动缓慢或排便反射减弱引起，常见于新生儿期至2岁的婴幼儿。
功能性便秘与年龄相关，因为此阶段儿童的神经系统及消化系统的发育尚未完全成熟，无法有效地控制排便时间和频率。此外，食物不耐受、乳糖不耐受等也可能导致功能性便秘的发生。
功能性便秘还可能与饮食不当有
关，例如喂养不足或奶粉配比不合理，这可能导致水分摄入不足，粪便干结难以排出。
对于功能性便秘的婴儿，家长应注意调整其饮食结构，确保足够的水分摄入，并在医师指导下使用轻柔的腹部按摩和肛门刺激以促进排便。若便秘持续不改善，应及时就医评估是否需要药物治疗。
