新冠疫苗一般是指新型冠状病毒疫苗，打了新型冠状病毒疫苗后小便刺痛，可能是药物不良反应所致，也不排除是泌尿系统感染、外伤、尿路结石引起，建议出现相关症状后，及时到医院泌尿外科就诊，完善尿常规等检查明确病因。

1、药物不良反应：新型冠状病毒疫苗属于一种新型疫苗，接种后可以增加人体对新型冠状病毒的抵抗力，从而降低感染的风险，但是在注射的过程中，由于每个人的体质不同，部分人群在注射之后可能会产生药物不良反应，如小便刺痛、头痛、呕吐等症状，此时无需进行特殊治疗。

2、泌尿系统感染：在接种新型冠状病毒疫苗之后，如果没有注意尿道部位的清洁和卫生，可能会导致细菌入侵，从而引起泌尿系统感染，炎症因子不断刺激尿道黏膜，就可能会引起小便刺痛的症状，有时还会伴随尿频、尿急等不适症状。此时可遵医嘱使用三金片、左氧氟沙星片等药物进行治疗。

3、外伤：如果在接种疫苗的过程中导致外阴部位受损，在小便时尿液对损伤部位造成刺激，就可能会引起小便刺痛的症状。此时可在医生指导下使用碘伏消毒，并注意外阴部位的清洁、卫生即可。

4、尿路结石：如果本身存在尿路结石，在接种新型冠状病毒疫苗后，由于剧烈活动等原因导致结石发生移位，若卡在输尿管中，可对输尿管造成刺激，从而引起小便刺痛的症状。此时可遵医嘱使用排石颗粒等药物进行治疗，也可考虑进行激光碎石。

建议在接种新型冠状病毒疫苗之后注意多休息，增加饮水量，还要注意局部卫生清洁，以免出现感染的情况。