小儿癫痫发作后头疼呕吐可能是由于神经元异常放电导致的脑功能障碍。

癫痫发作时，神经元异常放电会引起局部脑组织缺氧和水肿，进而导致颅内压力增高，出现头疼的症状。同时，剧烈的神经活动还可能导致胃肠平滑肌痉挛，进一步引发呕吐现象。

此外，如果患儿在癫痫发作期间受到头部创伤，也可能引起头痛、恶心和呕吐等症状。此时需要考虑是否伴有意识丧失或行为异常等其他症状以确定诊断。

面对儿童癫痫伴发头痛呕吐的情况，家长应注意观察患儿的临床表现，并及时就医进行磁共振成像等相关检查，以便明确诊断并接受适当治疗。