强直性脊柱炎疼了两个月可能是由于病情处于急性发作期或者治疗不当引起的。

强直性脊柱炎是自身免疫系统异常攻击脊椎关节所引起的疾病，通常呈慢性进展。当病情处于急性发作期时，免疫系统的异常反应会导致关节发炎和疼痛，如果不及时治疗或治疗方法不当，这种疼痛可能会持续数周至数月。此外，如果患者未接受规范化的药物治疗，如非甾体抗炎药或生物制剂等，也可能会导致疼痛持续存在。因此，在诊断为强直性脊柱炎后，应遵循医嘱进行规范化治疗以控制病情发展。

针对强直性脊柱炎的治疗包括非甾体抗炎药、糖皮质激素、生物制剂等药物治疗以及物理疗法，其中非甾体抗炎药如塞来昔布胶囊、美洛昔康片等，可以缓解症状；生物制剂如依那西普注射液、阿达木单抗注射液等，可调节免疫反应，延缓病情进展。

在确诊强直性脊柱炎后，建议定期复查，监测病情变化，并按医嘱调整用药方案。同时注意保持良好的姿势和适当的运动，有助于减轻症状并预防并发症的发生。