生殖器疱疹引起肌肉酸痛可能与HSV-2感染、神经炎、神经痛、免疫反应异常等有关，治疗需针对具体病因进行。

建议患者及时就医以获得专业指导。

1.HSV-2感染

当HSV-2病毒侵入人体后，在局部复制并形成水泡，导致炎症和疼痛。这些水泡可能会影响周围神经，从而引起肌肉酸痛。抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦等可用于治疗HSV-2感染，其通过抑制病毒DNA合成来减少病毒复制。

2.神经炎

神经炎是由各种原因引起的外周神经炎症反应，可导致感觉异常和肌肉酸痛。生殖器疱疹中的水泡破裂后，可能导致神经受损，进而诱发神经炎。营养神经的B族维生素是治疗神经炎的主要手段，包括维生素B1、B6、B12等口服制剂。

3.神经痛

神经痛是指由于神经受到压迫、刺激或损伤而引起的持续性或阵发性疼痛。生殖器疱疹病毒感染后，可能会对神经造成持久性的损害，导致长期的神经痛。三环类抗抑郁药如阿米替林、多塞平等常用于缓解神经痛，其机制主要是抑制去甲肾上腺素和5-羟色胺再摄取以延长其作用时间。

4.免疫反应异常

免疫系统对HSV-2感染产生过度的免疫应答，导致组织损伤和炎症，从而引起肌肉酸痛的症状。非甾体抗炎药如布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等可以减轻免疫反应异常引起的不适感。

建议定期进行生殖器部位的自我检查，注意观察是否有新出现的溃疡或异常变化。必要时，医生可能会推荐进行血液检测以确定是否存在HSV-2感染。