新生儿感染生殖器疱疹时，可能会出现皮肤红斑、水疱、疼痛、发热、头痛等症状，需及时就医。

1.皮肤红斑

当机体受到单纯疱疹病毒感染时，病毒会刺激局部组织和神经细胞，导致炎症反应和免疫应答，出现皮肤红斑。红斑通常出现在外阴、肛门等处，可能伴有轻微瘙痒或灼热感。

2.水疱

由于生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的，病毒复制会导致表皮细胞受损，形成小水疱。水疱多位于外阴、肛周区域，大小不一，可有渗出液。

3.疼痛

疼痛主要是由疱疹病毒对周围神经的直接侵犯所致，也可能因为炎症反应引发的神经敏感性增加。疼痛一般集中在感染部位，但有时也可能会扩散至其他区域。

4.发热

发热可能是机体免疫系统对病原体的一种防御反应，生殖器疱疹感染会引起身体产生一定的炎症反应，从而导致体温升高。发热通常为低到中度，但也可能出现高热，且可能伴随寒战或其他全身不适症状。

5.头痛

如果新生儿感染了生殖器疱疹，在疾病的急性期，体内免疫系统的异常激活会产生大量的炎性因子，这些因子会作用于中枢神经系统，导致头痛的发生。头痛可以是钝痛、搏动性痛或刺痛，位置不定，严重程度可从轻度到剧烈不等。

针对新生儿感染生殖器疱疹的情况，建议进行血液学检查以评估感染指标，如血常规、C-反应蛋白。必要时，医生还可能会推荐进行脑脊液分析或HSV抗原检测。新生儿感染生殖器疱疹的治疗需谨慎，通常采用静脉注射抗病毒药物，如膦甲酸钠氯化钠注射液、阿昔洛韦注射液等。对于新生儿患者，重点是监测病情进展并预防继发感染，同时保持患儿良好的营养状态和充足的休息。