胃肠吻合术后短时间内，患者的身体机能可能无法完全恢复到正常状态。

因为胃肠吻合术属于较大的外科手术，需要一定的时间来恢复身体的功能，包括胃肠道的生理结构和功能、血液循环等。在术后的一段时间内，身体仍在适应新的解剖结构和消化过程，此时可能会出现一些不适症状，如恶心、呕吐、腹泻等。随着术后时间的延长，这些不适症状会逐渐减轻或消失，身体机能也逐步恢复正常。

此外，如果患者存在术后并发症，如感染、出血等，则恢复时间会相应延长。

术后患者应遵循医嘱进行饮食调整和适当活动，以促进身体恢复，同时还要定期复查，监测病情变化。