输卵管囊肿怀孕了可以继续妊娠。

虽然输卵管囊肿可能影响输卵管功能，导致不孕或宫外孕等问题，但由于患者已经成功怀孕，说明囊肿暂时没有对胚胎发育产生直接的影响。但是，为了确保母婴健康，建议定期进行产前检查，并监测囊肿的变化情况。若囊肿持续增长或出现不适症状应及时告知医生处理。

如果囊肿较大或者有破裂、扭转等并发症发生，则需要考虑终止妊娠并进行手术治疗。

孕期及产后需密切监测囊肿变化，避免剧烈运动以减少腹压增高引起的囊肿破裂风险。