睡觉起来左肩胛骨酸痛可能是睡眠姿势不当、枕头过高、肩周炎、颈椎病、肌筋膜炎等病因导致的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的诊断和治疗。

1.睡眠姿势不当

睡眠姿势不当可能导致肌肉长时间处于紧张状态，引起局部血液循环受阻，从而导致左肩胛骨出现酸痛的症状。调整睡眠姿势可以缓解不适症状，如使用正确的睡姿和合适的枕头高度。

2.枕头过高

枕头过高会使颈部过度前屈，增加颈部长时间负担，进而诱发疼痛。此外，还可能影响头部、颈部的自然曲线，加重不适感。选择合适高度的枕头有助于减轻压力，例如挑选一个8-10厘米高的枕头。

3.肩周炎

肩周炎是由于肩关节周围软组织发生退行性改变而引起的炎症反应，在炎症因子刺激下，会引起肩部疼痛的情况发生。患者可在医生指导下通过针灸等方式进行治疗，能够起到一定的作用。

4.颈椎病

颈椎病通常由颈椎间盘退变、突出等原因所致，当突出的椎间盘压迫到周围的神经根时，会导致肩背部放射性疼痛的发生。非甾体抗炎药可作为常见的治疗方法来缓解疼痛，如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等药物。

5.肌筋膜炎

肌筋膜炎是指发生在肌筋膜部位的无菌性炎症，多为长期劳损或外伤后软组织修复过程中形成的纤维化病变，易在睡眠中牵拉形成酸痛。针对此类患者的治疗主要是放松肌肉并减少炎症，如遵医嘱服用双氯芬酸钠缓释片、塞来昔布胶囊等药物。

建议患者日常生活中注意休息，避免剧烈运动，以免加重不适症状。若症状持续不缓解或者伴有其他不适，应及时就医进行相关检查，如X光检查、MRI检查等，以排除骨折或其他潜在的骨骼问题。