肺孢子菌肺炎的治疗可以考虑复方磺胺甲恶唑、克林霉素、阿奇霉素、泼尼松、环磷酰胺等药物治疗。如果病情严重或有并发症，应立即就医以获得专业治疗。

1.复方磺胺甲恶唑

复方磺胺甲恶唑通过抑制细菌的生长繁殖来治疗肺孢子菌肺炎。此药主要用于敏感原虫所致的各型疟疾预防和治疗。

2.克林霉素

克林霉素能有效抑制细菌蛋白质合成，从而起到抗菌作用。

本品可透过细胞壁，在细胞内脱去氯离子而发挥杀菌作用。适用于革兰阳性菌引起的感染性疾病，如扁桃体炎、骨髓炎等。

3.阿奇霉素

阿奇霉素能够干扰细菌蛋白质合成，进而抑制细菌的生长繁殖，达到抗菌效果。本品可用于多种细菌性感染，包括急性咽炎、急性扁桃体炎等。

4.泼尼松

泼尼松具有抗炎、免疫调节的作用，可以减轻炎症反应，缓解肺孢子菌肺炎的症状。本品用于自身免疫性疾病的患者，需长期使用时应定期评估疗效，并调整剂量。

5.环磷酰胺

环磷酰胺是一种烷化剂类化疗药物，其分子结构中的杂原子氮上的电子云密度较高，因此它具有较强的亲电性和极强的亲核进攻能力，使DNA双链发生断裂，导致细胞死亡。本品适用于恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤等疾病。

在治疗肺孢子菌肺炎的过程中，应注意监测病情变化及可能出现的不良反应。同时，患者应保持充足的休息，遵循医嘱完成整个疗程以防止耐药性的产生。