新生儿乳糖不耐受可以考虑使用双歧杆菌、乳酶生、胰蛋白酶、胰脂酶或乳糖酶等药物进行治疗。但是，由于新生儿的特殊体质，建议在儿科医生的指导下使用药物，并且家长不宜自行给新生儿用药。
1.双歧杆菌
双歧杆菌适用于肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀。该药物能够抑制有害细菌的生长，促进有益菌繁殖，恢复正常的肠道微生态环境。使用时需注意不宜与抗菌药同时服用，以免影响其发挥作用。
2.乳酶生
乳酶生可用于消化不良、肠炎及小儿腹泻等病症。此药可帮助分解食物中的乳糖，改善乳糖不耐受引起的相关不适症状。本品应置于阴凉处保存，并且开封后要尽快用完。
3.胰蛋白酶
胰蛋白酶用于治疗胰腺功能不足导致的消化不良，包括乳糖不耐受。该药物能水解蛋白质，有助于将大分子蛋白质分解为小分子肽和氨基酸，从而利于人体吸收。对于急性重症肝炎患者禁用。
4.胰脂酶
胰脂酶适用于由胰腺外分泌功能不全所致的脂肪消化吸收障碍。通过增加脂肪酶活性来改善乳糖不耐受患者的消化吸收功能。对本品过敏者禁用。
5.乳糖酶
乳糖酶主要用于先天性乳糖酶缺乏所引起的乳糖不耐受症。可以催化体内的乳糖分解成葡萄糖和半乳糖，减轻乳糖不耐受的症状。建议随餐服用，以减少胃肠道不适的发生率。
针对新生儿乳糖不耐受的情况，家长应注意调整饮食结构，避免食用高乳糖食品，如牛奶及其制品。必要时，可在医生指导下使用无乳糖配方奶粉进行喂养。
