血清阴性脊柱炎的后果因人而异，通常取决于疾病的活动性和治疗及时性。

疾病活动性反映了病情的活跃程度，与患者的症状、体征以及实验室指标相关；治疗及时性则涉及早期诊断及规范化的药物干预，以减少关节损伤和功能丧失的风险。良好的活动性和及时治疗有助于控制病情，降低不良后果的可能性

。反之，则可能导致持续的疼痛、残疾或其他长期健康问题。

血清阴性脊柱炎可能伴随有皮肤黏膜病变，如口腔溃疡或脱发等，这些症状可作为预后指标之一。

患者应定期监测疾病活动性及相关症状的变化，以便及时调整治疗策略，并预防并发症的发生。