睡觉起来上颚疼可能是由睡眠姿势不当引起的局部压迫、张口呼吸导致的上气道粘膜干燥、急性上呼吸道感染、急性化脓性扁桃体炎、口腔溃疡等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.睡眠姿势不当引起的局部压迫

长时间保持一个不良睡姿会导致身体某一部位受到持续的压力，从而引起疼痛。调整睡眠姿势可以缓解不适感。例如，使用枕头支撑头部和颈部，避免长时间仰卧等。

2.张口呼吸导致的上气道粘膜干燥

由于长期用嘴呼吸会造成上气道黏膜水分蒸发过快，从而引起黏膜干燥、上腭肿胀等一系列病理变化，进而出现疼痛的症状。患者可尝试使用加湿器提高环境湿度，或通过鼻腔冲洗来湿润空气。

3.急性上呼吸道感染

急性上呼吸道感染是由病毒或细菌侵袭上呼吸道引起的炎症反应，炎症因子刺激上颚处神经末梢，导致其敏感度增加而产生疼痛。抗生素是主要治疗方法，如阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等；病毒感染者则需服用抗病毒药物，比如利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦颗粒等。

4.急性化脓性扁桃体炎

急性化脓性扁桃体炎通常由B型溶血性链球菌感染所致，在炎症因子的作用下，会引起咽部充血水肿，当病变波及到腭扁桃体时就会诱发剧烈疼痛。患者可在医生指导下口服青霉素V钾片、氨苄西林钠克拉维酸钾片进行抗感染治疗。

5.口腔溃疡

口腔溃疡的发生可能与遗传、免疫因素、精神压力大等因素有关，这些因素可能导致口腔黏膜局部发生炎症反应，从而形成溃疡点，引起疼痛。建议患者平时注意休息，保证充足的睡眠时间，避免过度劳累，以免加重病情。

针对上颚疼痛的情况，建议及时就医以确定具体原因并接受适当治疗。必要时，医生可能会推荐进行影像学检查，如X光检查或CT扫描，以排除其他潜在的结构性问题。