甲硝唑凝胶可以辅助治疗肛窦炎。

甲硝唑凝胶具有抗菌作用，能够抑制多种厌氧菌的生长，而肛窦炎多为厌氧菌感染所致。因此，该药物有助于缓解症状。

但患者应在医师指导下用药，不可自行盲目用药。

患者还可以遵医嘱使用红霉素软膏、氢化可的松乳膏等外用抗生素类药膏进行局部抗感染治疗。

在治疗肛窦炎期间，患者应注意个人卫生，避免便秘或腹泻，以减少炎症刺激。