柴胡疏肝丸可以缓解由情志不畅、肝郁气滞所引起的胁肋胀满、窜痛、腹胀便秘、舌苔薄白等症状，对于肝囊肿并没有明确的作用。
因为柴胡疏肝丸中的柴胡、枳壳具有一定的解表退热功效，而川芎则能够起到活血行气的作用，从而达到疏肝理气的效果，适用于上述提及的症状。而对于肝囊肿，主要是由于肝内某些管道结构发生堵塞，导致液体在肝内逐渐聚集形成的，因此并不能通过此药进行治疗。
针对肝囊肿，患者可遵医嘱使用熊去氧胆酸等利水消肿药物进行治疗。该疾病若无症状或增长缓慢，则无需特殊处理，定期复查即可。
在服用柴胡疏肝丸时需注意可能出现的胃肠道不适反应，并且不宜与滋补类中药同服。对于肝囊肿而言，建议患者避免酒精摄入，以减少肝脏负担。
