新生儿先天性膈疝手术呼吸机的价格因病理因素差异而异，通常在5000元至20000元之间。

新生儿先天性膈疝是指由于胚胎发育异常导致部分内脏组织或器官通过膈肌缺损部位膨出至胸腔外的一种先天性疾病。手术治疗是常见的治疗方法之一，需要使用呼吸机辅助通气以维持患儿的呼吸功能。如果新生儿先天性膈疝症状较轻，未引起严重的肺部感染或其他并发症，则手术及术后管理费用相对较低。

若新生儿先天性膈疝伴有严重的肺部合并症，如肺动脉高压、持续性肺动脉高压等，则会导致手术难度增加，进而使手术费用相应增高。

在考虑新生儿先天性膈疝手术呼吸机费用时，应综合评估患儿的具体情况，并遵循专业医生的指导，以确保医疗质量和安全。