舌根上长泡泡可以考虑中药调理、口腔黏膜保护剂、镇痛药物、激光治疗、微波治疗等方法进行治疗。如果泡泡持续不消退或伴有疼痛、吞咽困难等症状，建议及时就医以获得专业治疗。

1.中药调理

中医师根据患者症状开具汤药或丸散等内服，如黄连、板蓝根等具有清热解毒功效的中药材。适用于舌根泡伴有口干舌燥、咽喉肿痛等症状时。需个体化调配，并注意观察可能出现的不良反应。

2.口腔黏膜保护剂

通过在受损区域形成一层保护层来减轻疼痛和促进愈合，例如使用复方苯佐卡因凝胶、曲安奈德口腔软膏等。用于缓解舌根上的小水疱引起的轻微不适。主要针对轻度至中度疼痛及预防继发感染。

3.镇痛药物

通过抑制神经传导路径中的特定受体来减少疼痛信号传递，如口服布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等非处方止痛药。若舌根部水泡引起明显疼痛，可考虑使用。须遵医嘱选择合适剂量和频次以控制副作用风险。

4.激光治疗

利用高能量激光束精确地切除异常组织，在门诊条件下完成，常见设备包括二氧化碳激光器、半导体激光器等。对于经确诊为良性肿瘤且大小适中的舌根水泡可行激光去除。目标是准确切除病变部位而不损伤周围健康组织。

5.微波治疗

微波能量被病变组织吸收后产生高温效应导致其坏死脱落，通常在局部麻醉下实施。当舌根上的水泡较大或存在一段时间而未自行消退时可采用此法。适合处理表浅但深度较大的病变。

在接受舌根上泡泡的治疗过程中，应保持良好的口腔卫生，避免辛辣刺激性食物，多饮温水，以促进愈合和减轻不适感。