总是卵巢囊肿隐隐作痛可能是由激素水平异常、盆腔炎、子宫内膜异位症、输卵管积水、卵巢扭转等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.激素水平异常

激素水平异常可能导致生殖系统组织结构变化和稳定性下降，进而引起卵巢囊肿。当囊肿压迫周围组织时，可能会出现隐隐作痛的症状。针对此病因，可以考虑使用孕激素类药物进行调理，如黄体酮、地屈孕酮等。

2.盆腔炎

炎症因子刺激会导致盆腔充血水肿，继而诱发疼痛。此外，还可能伴随发热、阴道分泌物增多等症状。患者可遵医嘱服用抗生素进行抗感染治疗，常用药物包括头孢曲松钠、多西环素等。

3.子宫内膜异位症

子宫内膜异位症是指具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔与子宫肌层以外部位所引起的疾病状态。异位的子宫内膜受到激素的影响发生周期性出血，导致局部结缔组织纤维化形成粘连带，从而引起下腹痛、经期延长、月经量增加等不适症状。对于子宫内膜异位症所致的疼痛，通常采用非甾体抗炎药进行止痛处理，如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等。

4.输卵管积水

输卵管积水是慢性输卵管炎中较为常见的类型，在炎症刺激下，输卵管黏膜上皮细胞受损，纤毛运动减弱，管腔内分泌液积聚，逐渐形成积水。由于炎症反应存在，此时输卵管蠕动能力降低，易引起腹部隐痛的情况发生。若确诊为输卵管积水，则需要通过手术的方式进行治疗，例如输卵管近端阻塞者可行输卵管插管通液术、输卵管造口术等；远端梗阻者可通过输卵管伞成形术、输卵管切除术等方式来改善病情。

5.卵巢扭转

卵巢扭转是因为卵巢韧带异常导致卵巢发生旋转，使卵巢血液循环受阻，此时卵巢处于缺血的状态，容易引发疼痛的现象。如果确诊为卵巢扭转，建议及时就医并配合医生通过腹腔镜下卵巢复位固定术、患侧附件切除术等方法来达到治愈的目的。

针对持续存在的卵巢囊肿隐隐作痛症状，建议定期复查超声波检查以监测囊肿的变化。同时，保持良好的生活习惯，避免过度劳累和精神压力，有助于减少症状的发生。