儿童慢性肉芽肿通常不能自愈，但可以通过药物治疗、手术治疗等方法控制病情发展，达到临床治愈的效果。

儿童慢性肉芽肿是由于机体免疫系统对特定病原体感染后产生的慢性炎症反应。如果不及时治疗，可能会引起反复发作的感染和组织损伤，严重时可影响生长发育。通过规范化的治疗，可以有效地控制病情，减少并发症的发生，提高生活质量。

如果患者出现呼吸困难或吞咽困难等症状，可能需要紧急气管插管或食道支架置入术来缓解症状。

在治疗儿童慢性肉芽肿的过程中，应密切监测患者的免疫状态和感染风险，并定期评估治疗效果和副作用。饮食方面宜清淡且营养均衡，避免食用辛辣刺激性食物。