百日咳恢复期咳嗽加重可能是由免疫功能低下、气道敏感性增高、慢性支气管炎、肺结核、支气管扩张症等病因引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.免疫功能低下

由于免疫系统无法有效对抗感染，可能导致病情反复或迁延不愈，从而出现咳嗽加重的情况。可以遵医嘱使用免疫增强剂进行治疗，如转移因子口服溶液、脾氨肽口服溶液等。

2.气道敏感性增高

当患者存在过敏体质时，在接触花粉、尘螨等过敏原后，可能会导致机体释放炎症介质，引起气道平滑肌收缩和黏膜水肿，进而诱发咳嗽加剧的现象。针对此病可遵照医生的意见给予抗组胺药物以减轻症状，常用有氯雷他定片、盐酸西替利嗪胶囊等。

3.慢性支气管炎

慢性支气管炎是由长期吸烟、空气污染等因素引起的气管和支气管黏膜慢性炎症。炎症会导致气道分泌物增加和气道痉挛，引起咳嗽。患者可在医生指导下服用止咳化痰类药物缓解不适，例如复方甘草片、川贝枇杷膏等。

4.肺结核

肺结核是由结核分枝杆菌感染引起的传染病，可通过飞沫传播。结核分枝杆菌侵袭肺部组织，导致局部炎症反应和渗出液积聚，引起干酪样坏死灶形成，此时会出现百日咳恢复期咳嗽加重的症状。建议配合医生通过异烟肼片、利福平胶囊等方式来进行抗结核菌治疗。

5.支气管扩张症

支气管扩张症是一种慢性呼吸道疾病，主要由支气管壁肌肉薄弱、管腔狭窄所致。病变部位常伴随细菌感染，这些因素共同作用下会引起持续性的咳嗽、咳痰等症状。患者应遵循医师意见采用抗生素控制感染，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等。

患者需要保持充足的休息，避免剧烈运动，以免加重呼吸负担。同时还要注意营养均衡，适当补充富含维生素C的食物，如新鲜水果蔬菜，有助于提高免疫力，促进身体康复。