北京治疗肛瘘最专业的医院可以考虑北京肛肠医院，该专科医院在北京肛肠医院十佳排行榜单中名列前茅。除此之外，患者也可以选择首都医科大学附属北京同仁医院、北京协和医院、北京大学靠前医院、中国人民解放军总医院靠前医学中心等大型综合医院进行治疗。
1.首都医科大学附属北京同仁医院
首都医科大学附属北京同仁医院是北京市的一所大型综合性医院，其消化内科在业内享有较高声誉。该院的消化内科专注于胃肠道疾病的诊断与治疗，在内镜技术方面处于领先地位，且拥有先进的设备及经验丰富的医疗团队。
2.北京协和医院
北京协和医院是中国历史最为悠久、比较有影响力的医院之一，其消化科在国内享有盛誉。该科室致力于各种胃肠疾病的研究与诊治工作，具有雄厚的技术实力和临床经验积累。
3.北京大学靠前医院
北京大学靠前医院是一所集医疗、教学、科研于一体的三级甲等综合医院，其消化内科是国内知名的临床重点学科。该科室在消化系统疾病的诊疗方面积累了丰富的经验，并积极开展新技术新方法的应用研究，为患者提供高质量的医疗服务。
4.中国人民解放军总医院靠前医学中心
中国人民解放军总医院靠前医学中心是卫生健康委员会指定的全国疑难重症诊治指导中心之一，其消化内科在军内外享有较高声誉。该科室拥有一支由国内知名专家组成的高水平医疗队伍，能够开展各类复杂的消化道手术，并具备处理急危重症的能力。
5.北京肛肠医院
北京肛肠医院是一家专业治疗肛肠疾病的医院，设有独立的肛瘘门诊，可满足患者的个性化需求。该医院采用传统中医手法结合现代科技手段进行诊治，具有独特的治疗方法，深受广大患者信赖。
肛瘘是一种常见的肛门疾病，建议定期进行肛周检查以及保持良好的个人卫生习惯。