细菌性肠炎不会自愈。

该疾病是由于特定的致病菌感染所致，不存在自愈的情况。如果不及时进行抗感染治疗，可能会引起严重的并发症，甚至危及生命。因此，一旦确诊为细菌性肠炎，应立即开始相应的药物治疗。

在某些轻微的情况下，例如患者自身免疫系统可能通过产生针对特定病原体的抗体来控制病情的发展，从而实现自限性恢复。

此外，在治疗过程中，患者应注意休息，避免剧烈运动，以减少肠道负担，并促进身体康复。