儿童进行肛门指检时一般不会有明显疼痛。

肛门指检是医生通过戴手套、润滑手指后，将食指伸入患者肛门内进行触摸检查的一种方法。该操作能够帮助医生了解患者的肛门及直肠部位有无异常肿块、炎症等问题。由于儿童的肛门括约肌发育不完善，在进行指检时并不会产生明显的疼痛感。

如果儿童在肛门指检过程中出现不适或疼痛，可能是因为存在痔疮、肛裂等疾病导致局部敏感性增加所致。

进行肛门指检前应告知孩子此过程可能会感到轻微不适，并给予安抚以减轻紧张情绪。如有必要，可使用适量润滑油辅助润滑肛门区域。