长期过量食用益生菌可能会破坏肠道内的微生物平衡，不利于身体健康。

因为益生菌能够帮助调节肠道菌群，改善消化吸收功能。但若长期过量摄入，则可能导致某些有益菌过度繁殖，进而抑制有害菌生长，引起肠道内环境失调。此外，还可能出现腹胀、腹泻等不适症状。

因此，在使用益生菌时应遵循医嘱或产品说明书推荐剂量，并注意个体差异及可能出现的不良反应。

对于特定疾病状态或治疗方案中明确包含益生菌的部分，可能需要在医生指导下长期服用。需要注意的是，不同类型的益生菌其适应症与作用机制存在差异，选择时需考虑个体健康状况及目标效果。

在选择益生菌作为保健品或辅助治疗手段时，应注意产品的来源、功效及适宜人群，并按推荐用量服用。同时还要关注是否存在潜在的药物相互作用或其他禁忌证，以确保安全有效地使用益生菌产品。