真菌性肠炎的治疗可以考虑抗真菌药物治疗、益生菌疗法、肠道休息、电解质平衡调整、营养支持治疗等措施。

1.抗真菌药物治疗

抗真菌药物通过破坏真菌细胞壁或干扰其生长繁殖来发挥作用。

例如氟康唑可抑制真菌细胞膜上固醇合成酶的活性。此方法适用于真菌感染引起的肠炎患者。需密切监测肝功能，避免长期使用以防耐药性的产生。

2.益生菌疗法

益生菌能够竞争性地抑制病原菌附着于肠黏液上皮细胞，并且能促进机体分泌防御素、抗菌肽等免疫调节因子，进而增强机体免疫力。对于存在腹泻症状的真菌性肠炎患者而言，补充有益细菌有助于恢复肠道微生态平衡。

3.肠道休息

肠道休息可以减少食物对受损肠道黏膜的刺激，有利于炎症消退和愈合。对于急性期发作的真菌性肠炎伴有严重腹痛、腹泻时，短期禁食是必要的。

4.电解质平衡调整

电解质平衡调整旨在维持体内钠、钾等离子在正常范围内的稳定状态，防止因失衡导致的心律不齐等问题发生。对于有水电解质紊乱风险的真菌性肠炎患者至关重要，可通过口服补盐溶液或静脉注射进行纠正。

5.营养支持治疗

营养支持治疗提供必要的营养成分以辅助身体修复受损组织及对抗感染；可预防并发症如蛋白质-能量消耗症候群。针对慢性或复发性真菌性肠炎合并重度营养不良者实施。

真菌性肠炎患者应避免食用可能加剧肠道不适的食物，如辛辣、油腻食品。同时，保持充足的水分摄入，以利病情恢复。