肺炎胸膜炎引起肩胛部刺痛可能是由结核杆菌感染、金黄色葡萄球菌感染、真菌感染、病毒感染、胸部外伤等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.结核杆菌感染

结核杆菌侵入肺部后，会引起炎症反应和免疫应答，导致肺组织受损。当病变累及胸膜时，会出现胸膜炎的症状，如胸痛、咳嗽等。患者可以在医生指导下使用异烟肼、利福平等抗结核药物进行治疗。

2.金黄色葡萄球菌感染

金黄色葡萄球菌通过血液循环进入肺部，可引起化脓性感染，导致胸膜发炎。胸膜受到刺激和炎症因子的影响，可能会出现疼痛感。针对金黄色葡萄球菌引起的胸膜炎，通常采用青霉素类抗生素如阿莫西林克拉维酸钾进行治疗。

3.真菌感染

真菌感染主要是由念珠菌属、曲霉菌属等致病真菌侵犯人体所引起的疾病，如果真菌侵犯到肺部，则会导致肺部发生炎症，进而诱发胸膜炎的发生。对于真菌感染所致的胸膜炎，需要遵医嘱使用氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等抗真菌药物进行治疗。

4.病毒感染

病毒入侵机体后，在呼吸道内大量复制并扩散至全身各处，其中就包括肺部和胸膜。这些病毒可以刺激局部组织产生炎症反应，从而引发胸膜炎。若是由病毒感染引起的胸膜炎，患者可在医生指导下服用磷酸奥司他韦颗粒、扎那米韦吸入粉雾剂等抗病毒药物进行缓解。

5.胸部外伤

胸部外伤可能导致肋骨骨折或软组织损伤，这些都可能引起胸膜的炎症反应，导致胸膜炎的发生。胸部外伤引起的胸膜炎通常需要物理治疗，如穿戴弹力背心以提供支持和稳定受伤区域。

建议定期复查胸部X光片或CT扫描以监测病情进展，同时注意休息，避免剧烈运动，以免加重肩胛部不适。