肛管湿疣患者可以在医生指导下使用咪喹莫特、氟尿嘧啶等外用药膏进行局部涂抹治疗。

上述药膏具有一定的免疫调节作用及细胞毒作用，能够刺激机体产生干扰素，并且还能够抑制细胞DNA合成，从而达到抗病毒的效果。但需注意的是，以上药物均需遵医嘱合理应用，不可盲目自行使用，以免引起不良后果。

除了药物治疗外，若患者的病情比较严重或存在复发等情况，则需要考虑手术治疗的方式，比如冷冻疗法、激光治疗等。

在治疗肛管湿疣的过程中，患者应注意个人卫生，避免过度清洗和摩擦患处，保持患处干燥清洁，以减少不适症状的发生。