西地那非有轻微至中度的副作用，包括头痛、面部潮红和视力异常。

西地那非能够增强一氧化氮介导的阴茎海绵体勃起反应，从而产生治疗作用，但是同时也会导致血管扩张，引起头痛、面部潮红等副作用；此外，由于其与硝酸酯类具有相似的作用机制，因此不建议与硝酸酯类合用，以免引起严重的低血压甚至晕厥的情况发生。

长期服用西地那非还可能出现耐药性、心脏损害以及增加患青光眼的风险。

使用西地那非时需注意个体差异及可能发生的不良反应，并遵循医嘱调整剂量或停药。

患者在用药期间应避免驾驶机动车辆或操作危险机械，以减少因眩晕而造成意外伤害的可能性。