藿香正气水外用时需谨慎，尽量避免直接接触敏感皮肤以减少不适症状的发生。
藿香正气水中含有多种中药成分及乙醇，其具有一定的刺激性和致敏性，可能导致局部皮肤出现瘙痒、红肿等症状。因此，不推荐将藿香正气水直接涂抹于肛门区域。如果误将藿香正气水涂到肛门上出现了瘙痒的症状，可以通过清水冲洗的方式缓解不适症状，严重者则需要及时就医处理。
如果患者对酒精过敏，则不能使用藿香正气水。
此外，服用藿香正气水期间不宜驾驶机动车辆以及操作精密仪器。
在使用藿香正气水时要严格遵循医嘱，不可自行盲目用药，以免引起不良后果。服药后若出现皮疹、瘙痒等过敏反应，应停药并向医生咨询。
