肛门疼痛伴有右侧小腹疼痛可以考虑采取中药调理、肛门括约肌松弛训练、直肠前突修补术、经腹会阴联合直肠切除术、直肠黏膜环切术等方法进行治疗。如果症状持续或加剧，建议及时就医以确定具体原因并接受适当治疗。

1.中药调理

通过内服外敷的方式，如使用马应龙麝香痔疮膏、红霉素软膏等局部用药，可减轻炎症反应，缓解肛门及小腹部疼痛。

适用于轻度至中度的肛门及小腹部不适症状。

2.肛门括约肌松弛训练

此训练旨在增强肛门括约肌的力量和紧致度，从而改善肛门功能，对因括约肌松弛引起的疼痛有帮助。通常包括提肛运动和盆底肌肉锻炼。适合于任何年龄人群，特别是需要长期坐姿工作的人群。

3.直肠前突修补术

手术目的是修复薄弱的盆底组织，恢复直肠正常位置，常用开放式或腹腔镜下微创手术方式进行。主要针对慢性便秘、严重脱垂患者，需在医生指导下根据个体情况决定是否采用。

4.经腹会阴联合直肠切除术

该手术是治疗低位直肠癌的主要手段之一，通过切除病变部位以达到治愈目的，在全身麻醉下由外科医师执行。主要用于治疗低位直肠癌，需严格遵循医嘱进行，并注意术后并发症监测。

5.直肠黏膜环切术

该手术用于治疗出口梗阻性便秘，通过切除部分冗余结肠来缓解排便困难，一般采取开放或腹腔镜下微创技术进行。对于存在顽固性排便障碍且无明显器质性病变者适用，实施时需考虑患者的全身状况及可能的风险。

在处理肛门疼痛伴有右侧小腹痛时，应避免食用辛辣刺激性食物，以免加重炎症反应。同时建议增加膳食纤维摄入量，保持大便通畅，减少久坐时间，适当进行体育活动，以促进血液循环，缓解症状。