结膜炎引起脑袋疼可能是感染性结膜炎、过敏性结膜炎、干眼症、角膜炎、青光眼等疾病因素导致的，需要根据具体病因进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得正确的诊断和治疗。

1.感染性结膜炎

感染性结膜炎是由细菌、病毒等病原体引起的结膜炎症，这些病原体会释放毒素和刺激性物质，导致眼部不适和头痛。患者可在医生指导下使用抗生素药膏如四环素眼膏、金霉素眼膏进行局部抗感染治疗。

2.过敏性结膜炎

过敏性结膜炎是由于眼部接触过敏原引起的一种免疫反应，会导致结膜充血、水肿等症状。当炎症累及头部时，就会出现头痛的情况。患者可遵医嘱使用酮替芬滴眼液、富马酸依美斯汀滴眼液等抗组胺药物来缓解症状。

3.干眼症

干眼症是一种慢性泪液分泌不足或蒸发过快的眼表疾病，此时眼睛无法得到足够的湿润，从而诱发疼痛感。此外，干眼症还伴有眼痒、异物感、灼热感、畏光流泪等症状。针对干眼症的治疗通常包括人工泪液替代疗法以及促进泪液分泌的药物，如玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等。

4.角膜炎

角膜炎是指角膜上皮细胞受到损伤后发生炎症反应，炎症因子会刺激神经末梢，进而引起头痛的症状。角膜炎的治疗需首先明确致病原因，再对因治疗，如真菌性角膜炎可以遵照医生的意见用氟康唑滴眼液、那他霉素滴眼液等抗真菌药物进行治疗。

5.青光眼

青光眼是一组以视盘萎缩、视野缺损、视力减退为共同特征的疾病，其发病可能与遗传因素有关，也可能是由眼内压增高所致。若存在房水外流受阻或者排出不畅，则会引起眼压升高，压迫眼球组织，导致头痛的发生。对于急性闭角型青光眼，可通过激光周边虹膜切开术、激光小梁成形术等方式降低眼内压力；对于慢性单纯性青光眼则需要通过滤过性手术方式改善病情。

建议定期眼科检查，以便早期发现并处理结膜炎相关并发症。必要时，应进行裂隙灯显微镜检查、眼压测量和视野测试，以评估角膜炎和青光眼的影响。