睡眠呼吸暂停综合征是由于气道阻塞导致的夜间低通气状态，此时为了保持呼吸道通畅，机体需要通过改变体位来缓解症状，这会增加颈部肌肉张力，从而引起脖子酸痛的现象。同时，由于长期的睡眠障碍，可能导致免疫力下降，易感因素增多，进一步加重了疼痛症状。
此外，如果患者存在慢性鼻炎、腺样体肥大等疾病时，也可能会出现打呼噜伴随鼻子根部疼痛的症状。因为这些疾病会导致鼻腔或咽部黏膜充血水肿，进而引发上述不适现象。
针对打呼噜伴有鼻子根部疼痛的症状，建议患者及时就医以确定病因，并接受相应治疗。日常生活中应避免过度疲劳，保持规律作息，有助于改善睡眠质量，减少打鼾的发生。
