脑炎后遗症的治疗需要个体化方案，可以考虑抗病毒治疗、免疫调节治疗、神经营养药物治疗、脑功能区电刺激治疗、针灸治疗等方法来改善症状。

1.抗病毒治疗

抗病毒治疗通过使用特定的抗病毒药物来抑制或清除体内病毒，减少神经细胞损伤。对于由特定病毒感染引起的脑炎后遗症可能有效。

2.免疫调节治疗

免疫调节治疗旨在平衡机体的免疫反应，通常采用注射免疫调节剂如干扰素的方式。适用于因自身免疫异常导致的脑炎后遗症患者。

3.神经营养药物治疗

神经营养药物可以促进受损神经元的修复和再生，常用药包括甲钴胺、维生素B等。适合于存在运动障碍、感觉减退等神经系统症状的情况。

4.脑功能区电刺激治疗

脑功能区电刺激是利用微弱电流刺激大脑皮层的方法来改善脑功能，主要通过植入式设备实现。针对有明确脑功能区异常的脑炎后遗症患者有益。

5.针灸治疗

针灸通过刺激穴位来调节气血流通，以达到舒经活络的目的。可辅助缓解肢体麻木等症状，在中医师指导下进行。

在选择治疗方法时，应根据患者的病情严重程度及个体差异制定个性化方案。除上述推荐的常规疗法外，还可考虑认知行为疗法，以帮助患者重建思维模式和应对策略，促进康复。