子宫内膜样卵巢囊肿是指患者存在子宫内膜异位症、子宫腺肌病、卵巢肿瘤等相关疾病，导致卵巢实质异常增生形成的囊肿，治疗上主要采取手术切除治疗，可辅助应用药物治疗。

1、子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可能与遗传因素、免疫因素、炎症因素等有关，子宫内膜样卵巢囊肿是指子宫内膜异位症的病灶种植在卵巢，伴随周期性增生、萎缩、坏死，因此患者可能出现月经紊乱、痛经、不孕等症状。此时可行腹腔镜手术治疗，如果术后病理提示为子宫内膜异位症，没有生育要求，可以考虑上曼月乐环治疗，或者进行全子宫切除手术治疗;

2、子宫腺肌病：子宫腺肌病多与子宫内膜炎症、遗传因素等有关，子宫内膜样卵巢囊肿是指子宫内膜腺体和间质侵入子宫肌层，形成的病灶，伴随有或不伴有子宫内膜增生的疾病，患者可表现为经量增多、经期延长、痛经等症状。对于症状较轻者，可应用达那唑、孕三烯酮等药物治疗，对于症状较重者，应行全子宫切除手术治疗;

3、卵巢肿瘤：卵巢肿瘤多与内分泌异常、遗传因素等因素有关，卵巢肿瘤多分为良性肿瘤与恶性肿瘤，可伴有腹痛、腹部包块、月经紊乱等症状。良性肿瘤可采取手术切除治疗，恶性肿瘤也应尽早手术切除治疗。

此外，还可能与畸胎瘤相关，畸胎瘤是由于原始生殖细胞异常增殖形成的肿瘤，可能会出现腹痛、腹部包块等症状，也可出现子宫内膜样卵巢囊肿。一般采取手术治疗，术后根据病理检查结果决定是否进行化疗。