肛门指检一般是指肛门直肠检查。肛门直肠检查后疼痛可能是正常现象，也有可能是由于感染、痔疮等原因引起的。

一、正常现象

肛门直肠检查时需要将手指伸入患者的肛门内进行触摸，从而判断是否存在病变的情况，在此过程中可能会对局部造成刺激，引起轻微的疼痛症状，属于正常的生理现象，并不需要特殊治疗，患者可以通过卧床休息的方式进行缓解，也可以通过热水坐浴的方式进行改善。

二、病理性因素

1.感染：如果在做肛门直肠检查的时候没有做好个人卫生工作，导致细菌侵入到伤口部位，则容易诱发感染，出现红肿、疼痛等症状。此时可以在医生指导下使用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗，同时还要注意保持局部清洁干燥。

2.痔疮：如果本身患有痔疮，在做完肛门直肠检查之后会导致病情加重，也会伴随明显的疼痛感。此时可以遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物止痛，必要时还可以通过手术切除的方式进行治疗。

除此之外，还可能与肛裂有关，建议及时就医进行治疗。