男人小便时会刺痛，可能是包皮龟头炎、尿道炎、前列腺炎、尿道结石等因素导致。若存在尿频、尿急等症状，可能是尿路感染疾病所引起，建议尽早就医检查，明确具体原因。

1、包皮龟头炎：男人不注意包皮部位的卫生，并且包皮过长，可能会导致包皮内部细菌滋生。在小便时细菌会进入尿道内，对尿道造成刺激，就可引起小便刺痛，可能还伴有龟头瘙痒、发红等症状;

2、尿道炎：可能与不洁性生活、卫生不良等因素有关，导致尿道内出现感染，尿道内存在脓性分泌物，在排尿时对尿道造成刺激，就会引起小便刺痛，还伴有排尿疼痛、尿频、尿急等症状;

3、前列腺炎：可能与过度手淫、长时间饮酒吸烟等因素有关，可导致前列腺局部肿大，对尿道造成刺激和压迫，就会引起小便刺痛，伴有尿不尽、尿滴白等症状;

4、尿道结石：可能与环境因素、饮食因素以及药物因素有关，在排尿的过程中，尿液会对结石造成冲击，使结石移动，可对尿道造成损伤，就会引起小便刺痛，通常还伴有排尿困难、血尿等症状。

此外，如果存在膀胱肿瘤疾病，肿瘤表面坏死或合并感染时，在排尿时，会对肿瘤造成刺激，也会引起排尿疼痛，可能还伴有下腹坠胀等症状。