多发性肝囊肿伴有胆囊结石可能是先天发育异常、寄生虫感染等原因引起的。患者需要根据不同的原因采取相应的治疗措施。

1.先天发育异常：如果在胚胎时期肝脏出现异常增生的情况，则可能会导致多发性肝囊肿的形成。而胆囊是人体的一个器官，在胚胎时期也会发生正常的生理变化，当其发生异常时就会引起胆囊结石的发生。对于这种情况一般不需要特殊处理，定期复查即可。

2.寄生虫感染：由于饮食不洁或者食用了含有蛔虫卵的食物等，会导致肠道内有蛔虫寄生，从而引发腹痛、腹泻等症状，并且还会刺激胆道系统，诱发胆汁淤积，最终会发展为胆囊结石。建议遵医嘱服用阿苯达唑片、甲苯咪唑片等药物进行驱虫治疗，必要时还需要通过手术的方式将病灶切除。

除此之外还可能与不良的生活习惯有关，建议及时就医完善相关检查，明确病因后对症治疗。日常生活中要注意合理膳食，避免吃辛辣油腻性的食物，比如辣椒、炸鸡等。同时还要注意多休息，保证足够的睡眠时间，尽量减少长时间熬夜。