睡醒后肝区隐痛，起床后就不痛了可能是非病理性因素引起的，也有可能是病理性因素导致的，比如胆囊炎、脂肪肝等。患者需要根据病因对症治疗。

一、生理性因素

如果在睡觉之前吃的食物过多或过少，可能会加重肝脏负担，从而出现上述症状的情况。一般不需要特殊处理，在平时要合理饮食，不要暴饮暴食。

二、病理性因素

1.胆囊炎：由于受到细菌感染所引起的一种疾病，会导致腹部疼痛，并且会伴随恶心呕吐等症状。可以在医生指导下服用消旋山莨菪碱片、熊去氧胆酸胶囊等药物进行治疗。

2.脂肪肝：长期饮酒或者经常吃高脂油腻食物，容易造成体内代谢紊乱，使血脂升高，引发脂肪肝，也会出现以上现象。可以遵医嘱使用奥利司他胶囊、阿托伐他汀钙片等药物进行治疗。

除此之外，还有可能与病毒性肝炎有关，建议及时就医明确具体原因后采取针对性措施来改善。