男科手术后小便刺痛，可能是术后感染、留置导尿管、龟头炎、尿道损伤引起，需要针对具体原因给予相应的治疗。

1、术后感染：如果是做的尿道手术，如包皮环切术等，切口在术后一周未愈合，可能在排尿时出现刺痛。此时应注意休息，必要时可口服头孢呋辛酯片等抗生素进行抗感染治疗，一般待切口愈合后排尿刺痛会消失;

2、留置导尿管：男科手术一般都会使用留置导尿管，如果导尿管不通畅，造成逆行感染，也可能在术后出现小便刺痛。此时需要取出导尿管，如果炎症比较重，可以口服头孢克肟片等抗生素进行治疗;

3、龟头炎：如果男科手术后因病情需要，长期留置导尿管，可能会导致龟头炎，炎症不断刺激龟头黏膜可引起疼痛。此时可以口服盐酸左氧氟沙星片、阿奇霉素片等抗生素进行治疗，同时要注意保持龟头部位的清洁、卫生;

4、尿道损伤：男科手术如果是在无菌操作下进行，可能会在导尿管或球囊中发生损伤尿道黏膜，排尿时尿液刺激损伤的尿道黏膜，会引起小便刺痛。此时可以口服左氧氟沙星片、头孢克肟片等抗生素进行治疗，一般待尿道损伤恢复后，排尿刺痛症状也会消失。

男科手术后小便刺痛要注意休息，多喝水，饮食要清淡，不要吃辛辣、刺激性食物，如果有不适症状要及时就诊，以免延误病情。