肛门指检和直肠镜检查，是相对于肛门视诊、直肠镜检查而言，属于较为常见的两种临床检查，可以协助医师进行临床诊断，但具体选择需根据患者病情而定。

1、肛门指检：即医生用食指伸进患者肛门中进行触诊，可以检查肛门、直肠有无炎症、息肉、痔疮等病变。通常是对肛门周围进行检查，不会对直肠造成损伤，常作为肛肠科常用的检查方法;

2、直肠镜检查：直肠镜是一种较为先进的纤维内镜，可以通过狭细的管腔伸入直肠中，对直肠进行观察，可以检查直肠中是否存在溃疡性病变、肿瘤、炎症等病变。在进行直肠镜检查时，可以对病变部位取活检，进行病理学检查，但是可能会导致患者出现不适或疼痛。但由于需要从肛门进行入路，所以存在一定的禁忌证，比如患者过度紧张时，会反复进行肛门指检，不易配合，此时较为不合适;

3、肛门直肠常规检查：如肛门直肠黏膜碘化试验、粪便隐血试验等，可以明确是否存在内痔、息肉等病变。通常是在患者排便后取出局部的分泌物，将局部的分泌物清洗后，使用碘伏对局部进行消毒，再使用特制的肛门镜或直肠镜进行探查。由于是从肛门进行检查，所以不会对直肠造成损伤，较为常用;

4、其他：如胶囊内镜、小肠镜等内窥镜检查，其中胶囊内镜只需在口服聚乙二醇等清肠药物后，即可通过肛门进入肠道内部进行检查。小肠镜需要通过口服或静脉注射造影剂后，通过肛门进入小肠进行检查。但由于是从口腔进行检查，可能存在恶心、反胃等不适情况。