做完肛瘘手术总感觉不舒服，可能是由于伤口疼痛所致，也有可能是因为肛周脓肿、水肿等因素所致。此外，如果患者对疼痛比较敏感，也可能是由于肛周感染所致。出现此种情况后建议及时到正规的医院进行就诊，明确病因后采取针对性措施进行治疗。

1、伤口疼痛：做完肛瘘手术总感觉不舒服，可能是由于伤口部位出现水肿或者感染的情况所致。患者可以在医生的指导下，使用高锰酸钾溶液进行坐浴，以促进伤口愈合，缓解疼痛的症状;

2、肛周脓肿：做完肛瘘手术总感觉不舒服，可能是由于肛周脓肿所致。肛周脓肿一般是由于肛腺阻塞感染引起，患者一般会出现肛周肿胀、疼痛等症状，部分患者还可能会出现肛瘘外口流出脓液的症状，并且伤口常常会反复发作，在流脓过后，局部会形成瘢痕硬块。如果明确为肛周脓肿，可以遵医嘱使用阿莫西林胶囊、红霉素软膏等抗生素类药物进行治疗;

3、水肿：做完肛瘘手术后，由于手术创伤的刺激，会导致肛周局部出现水肿的情况，患者可能会总感觉不舒服。可以在医生的指导下服用迈之灵片、地奥司明片等药物缓解水肿;

4、感染：做完肛瘘手术后如果不注意术后护理，可能会导致细菌等病原体侵入伤口，引起感染。伤口在炎症的刺激下会出现疼痛感，从而导致患者出现做完肛瘘手术总感觉不舒服的情况。可以遵医嘱服用替硝唑片、甲硝唑片等抗生素类药物进行治疗。