怀孕初期查出耳聋基因可能是由于孕妇本身携带耳聋基因导致的，也有可能是胎儿自身携带有耳聋基因引起的。建议根据具体情况进行针对性治疗。

一、原因

1.孕妇：如果孕妇在怀孕期间没有进行产前筛查，可能会出现怀孕初期查出耳聋基因的情况。因为大部分的先天性耳聋都是由遗传因素造成的，所以孕妇可能本身就携带了耳聋基因。

2.胎儿：如果孕妇在怀孕期间进行了产前筛查，并且检查结果显示胎儿有耳聋基因，则说明胎儿可能存在听力障碍的风险。

二、治疗

如果是孕妇本身携带耳聋基因导致的，一般不需要特殊治疗，定期到医院复查即可。但如果是因为胎儿自身携带有耳聋基因引起的，可以在医生指导下通过羊水穿刺术等方式明确诊断。必要时也可以遵医嘱选择合适的方法终止妊娠。

建议患者保持良好的心态，避免过度紧张和焦虑。同时注意饮食健康，可以适当进食富含蛋白质的食物，如鸡蛋、牛奶等，有助于补充机体所需要的营养物质。