孕检检查出耳聋基因，可能与遗传因素、环境因素、药物因素等有关。孕妇可根据自身情况和胎儿发育情况，在医生的指导下选择观察、药物治疗、手术治疗等方式进行处理。

1、遗传因素：如果家族中有耳聋的人，在怀孕期间进行耳聋基因筛查时，就可能会遗传给胎儿，导致胎儿出生后耳聋。如果不影响听力，可不进行处理，若影响听力，可通过植入人工耳蜗的方式进行治疗;

2、环境因素：如果在孕期长期处于噪音较大的环境中，就可能会导致耳蜗受损，出现孕检时检查出耳聋基因的情况。建议孕妇脱离噪音环境，在安静的环境中休息，一段时间后即可恢复;

3、药物因素：如果孕妇在孕期服用庆大霉素片、链霉素等药物进行治疗，也可能会导致耳朵听力下降，检查出耳聋基因。建议及时停止服用药物，并在医生的指导下更换其他药物进行治疗;

4、其他：如果孕妇感染病毒，出现耳毒性反应，或者感染细菌、病毒、真菌等病原体，也可能会导致孕检检查出耳聋基因的情况。建议孕妇做好日常防护，避免前往噪音环境或者感染病原体。如果感染病毒，可遵医嘱使用注射用单磷酸阿糖腺苷、盐酸伐昔洛韦片等药物进行治疗。

孕检检查出耳聋基因后，建议及时前往产科或耳鼻喉科就诊，通过羊水穿刺、无创DNA检测等检查明确病情。孕妇日常应注意远离噪音环境，避免情绪过于紧张，还应注意休息，避免熬夜。