精子畸形率高可以通过临床症状、体格检查、精液常规检查等方法进行判断。建议患者及时到医院就诊，明确具体病因后，在医生指导下采取针对性治疗措施。

1.临床症状：如果患者的精子畸形率比较高，则可能会出现少精、弱精等症状，严重时还会影响生育能力。另外，部分患者还会伴有尿频、尿急、尿痛等不适症状。

2.体格检查：在进行体格检查时，通常会观察阴茎的发育情况，并且还会对睾丸部位进行触诊，能够初步判断是否存在异常的情况。

3.精液常规检查：该检查主要是通过显微镜来观察精子的质量以及活力，从而判断精子是否正常。如果精子畸形率过高，则属于不正常的生理现象，可能与不良的生活习惯有关，比如长期吸烟酗酒或者是过度劳累等。

除此之外，还可以通过染色体检查、基因检测等方式辅助判断。若确诊为精子畸形症，可以在医生的指导下服用左卡尼汀口服溶液、维生素E片等药物进行治疗。必要时也可以遵医嘱通过手术的方式进行改善。