做完肛瘘手术大便后可以通过温水坐浴、使用药物、调整饮食等方式进行处理。

1.温水坐浴：患者在术后可以适当用温盐水或高锰酸钾溶液进行坐浴，能够起到清洁的作用，在一定程度上还可以促进局部血液循环，有利于伤口的愈合。但需要注意的是，坐浴时应注意避免时间过长，以免出现不适症状。

2.使用药物：如果患者在排便后出现了疼痛的情况，则可以在医生指导下服用布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等非甾体类抗炎药进行治疗，能够起到缓解疼痛的目的。同时，也可以遵医嘱涂抹红霉素软膏、夫西地酸乳膏等抗生素药物进行治疗，能够有效抑制炎症反应。

3.调整饮食：患者还需要注意合理饮食，尽量以清淡易消化的食物为主，比如小米粥、南瓜粥等，同时还应多吃新鲜的水果和蔬菜，如苹果、菠菜等，能够补充身体所需要的营养物质，有助于病情恢复。

除此之外，还可能通过其他方式，建议患者及时就医，根据不同的情况采取相应的处理措施。